Agentūroje veikia Ugdymo departamentas, Pasiekimų departamentas, Informacinių išteklių departamentas, Kokybės vertinimo departamentas, Pedagoginių darbuotojų departamentas, Bendrųjų reikalų departamentas.
Ugdymo departamentas:
- rengia ikimokyklinio ugdymo programos gairių, priešmokyklinio, pradinio, pagrindinio ir vidurinio ugdymo bendrųjų programų projektus, metodikas, rekomendacijas ir kitus dokumentus, reikalingus ugdymo turiniui įgyvendinti;
- kuria ikimokyklinio, priešmokyklinio ir bendrojo ugdymo programas įgyvendinančių švietimo įstaigų aprūpinimo standartą, analizuoja švietimo įstaigų aprūpinimo situaciją šalyje;
- analizuoja informaciją apie skaitmeninių mokymo priemonių naudojimą, prižiūri Agentūros sukurtas ar įsigytas skaitmenines mokymo priemones, Agentūros virtualiųjų mokymo aplinkų turinį;
- organizuoja vadovėlių ir kitų mokymo priemonių tinkamumo naudoti ugdymo procese vertinimą;
- vykdo prevencinių programų įgyvendinimo mokyklose stebėseną.
Pasiekimų departamentas:
- organizuoja ir administruoja mokinių pasiekimų patikrinimus, brandos ir kitus egzaminus, asmens bendrųjų gebėjimų, įgytų profesinių kompetencijų vertinimus;
- organizuoja valstybinės kalbos ir valstybinės kalbos mokėjimo kategorijos, lietuvių kalbos mokėjimo lygių nustatymo, Lietuvos Respublikos Konstitucijos pagrindų egzaminus, jų užduočių kūrimą;
- užtikrina mokinių pasiekimų patikrinimų užduočių parengimą ir jų kokybę, organizuoja valstybinių brandos egzaminų užduočių atlikimo vertinimą;
- analizuoja pasiekimų patikrinimų rezultatus pasiekimų patikrinimų užduočių kokybei užtikrinti, švietimo kokybei ir mokinių pasiekimams gerinti;
- vykdo mokinių pasiekimų nacionalinius ir tarptautinius kiekybinius ir kokybinius tyrimus, analizuoja rezultatus, teikia išvadas bei rekomendacijas mokinių pasiekimų gerinimo klausimais.
Informacinių išteklių departamentas:
- administruoja ir plėtoja valstybines švietimo informacines sistemas ir švietimo registrus;
- užtikrina technologinį brandos egzaminų ir pasiekimų patikrinimų užduočių elektroninį vykdymą;
- užtikrina švietimo informacinėse sistemose ir švietimo registruose esančių duomenų kokybę ir prieinamumą vartotojams;
- užtikrina informacinių sistemų, registrų ir skaitmeninių mokymo priemonių sklandų veikimą.
- teikia informacinę, ekspertinę, konsultacinę pagalbą švietimo subjektams, organizuojantiems ir įgyvendinantiems švietimo veiklą, susijusią su Departamento veikla.
Kokybės vertinimo departamentas:
- atlieka švietimo teikėjų veiklos rizikos analizę, organizuoja ir vykdo švietimo teikėjų planinius ir neplaninius patikrinimus jų veiklos kokybei įvertinti;
- organizuoja mokyklų, kvalifikacijos tobulinimo institucijų, pedagoginių psichologinių tarnybų veiklos vertinimą, akreditavimą;
- organizuoja licencijuojamos veiklos (profesinio mokymo) priežiūrą;
- teikia metodinę pagalbą, konsultacijas, įgyvendina kitas prevencines priemones, padedančias švietimo teikėjams laikytis švietimo politiką įgyvendinančių teisės aktų reikalavimų;
- taiko poveikio priemones, padedančias švietimo teikėjams veiksmingai ir kokybiškai vykdyti veiklą įstatymų ir pagal juos priimtų teisės aktų nustatyta tvarka.
Pedagoginių darbuotojų departamentas:
- analizuoja pedagoginių darbuotojų atitiktį kvalifikacijos reikalavimams; koordinuoja ir plėtotoja pedagoginių darbuotojų kvalifikacijos tobulinimo sistemą;
- analizuoja švietimo įstaigų vadovų, mokytojų ir pagalbos mokiniui specialistų atlygio sistemą ir karjeros tendencijas;
- organizuoja ir vykdo pretendentų į valstybinių ir savivaldybių švietimo įstaigų vadovus kompetencijų ar jam prilygintą vertinimą;
- organizuoja ir dalyvauja vykdant mokytojų ir pagalbos mokiniui specialistų praktinės veiklos vertinimą ir atestaciją, vykdo psichologų, teikiančių pagalbą mokiniui, atestaciją.
- užtikrina švietimo įstaigų vadovų rezervo funkcionavimą.
Bendrųjų reikalų departamentas:
- organizuoja Agentūros dokumentų valdymą ir archyvo darbą;
- užtikrina Agentūros rengiamų teisės aktų ar sutarčių atitikimą Lietuvos Respublikos įstatymams ir kitiems teisės aktams bei teisinės technikos reikalavimams;
- vykdo Agentūros viešųjų pirkimų procedūras, užtikrinti jų skaidrumą ir procedūrų atitiktį teisės aktų reikalavimams;
- užtikrina Agentūros naudojamo turto priežiūrą ir apsaugą, rūpinasi tinkamų darbo sąlygų darbuotojams sudarymu.
- organizuoja elektroninių ir popierinių leidinių leidybos procesus.
